Hovedforskjellen mellom glyfosat og paraquat ligger i deres virkemåter og bruksområder:

Handlingsmåte:

Glyfosat: Det virker ved å hemme et enzym som er involvert i syntesen av essensielle aminosyrer, og dermed forstyrre proteinproduksjonen i planter.Denne handlingen fører til systemiske effekter, som får planter til å visne og dø innenfra og ut.

Paraquat: Det fungerer som et ikke-selektivt kontaktugressmiddel, og forårsaker rask uttørking og død av grønt plantevev ved kontakt.Paraquat forstyrrer fotosyntesen ved å generere giftige frie radikaler i kloroplaster, noe som fører til vevsskade og plantedød.

Selektivitet:

Glyfosat: Det er et systemisk ugressmiddel som dreper et bredt spekter av planter, både gress og bredbladet ugress.Det brukes ofte i landbruk, landskapsarbeid og ikke-avlingsområder.
Paraquat: Det er et ikke-selektivt ugressmiddel som dreper de fleste grønne plantevev ved kontakt.Den brukes først og fremst i ikke-avlingsområder, for eksempel på ugress i industriområder, langs veikanter og i ikke-landbruksmiljøer.

Toksisitet:

Glyfosat: Det anses å ha lav toksisitet for mennesker og dyr når det brukes i henhold til instruksjonene på etiketten.Imidlertid er det pågående debatt og forskning angående dens potensielle økologiske og helsemessige konsekvenser.
Paraquat: Det er svært giftig for mennesker og dyr og kan forårsake alvorlig forgiftning hvis det svelges eller absorberes gjennom huden.På grunn av sin høye toksisitet er paraquat underlagt strenge regler og forholdsregler for håndtering.

Standhaftighet:

Glyfosat: Det brytes vanligvis ned relativt raskt i miljøet, avhengig av faktorer som jordtype, temperatur og mikrobiell aktivitet.
Paraquat: Det er mindre persistent i miljøet sammenlignet med glyfosat, men kan fortsatt vedvare i jord og vann under visse forhold, og utgjøre en potensiell risiko for ikke-målorganismer.

Oppsummert, mens både glyfosat og paraquat er mye brukte herbicider, er de forskjellige i virkemåter, selektivitet, toksisitet og persistens, noe som gjør dem egnet for forskjellige applikasjoner og forvaltningsstrategier.